Aegera possède un riche portefeuille de brevets internationaux couvrant tous ses programmes. Ce portefeuille comprend plus de 100 brevets délivrés et plusieurs demandes de brevet en instance protégeant chacun de ses programmes en cours de développement. 

Aegera détient une position dominante en ce qui a trait aux IAP, une famille de protéines jouant un rôle déterminant dans l’inhibition de l’apoptose. Plusieurs brevets délivrés aux É.-U. protègent les droits d’Aegera sur la majorité des protéines IAP connues dont XIAP, cIAP1, cIAP2, TIAP et NAIP, et incluant leurs gènes, protéines, peptides, anticorps et modifications respectifs.  

Aegera a concédé les droits non exclusifs sur plusieurs de ses brevets principaux concernant les IAP à plusieurs sociétés qui élaborent, fabriquent et vendent des outils de recherche et  des réactifs reliés à ces membres de la famille IAP.